A Faculdade de Ciências Médicas da UNIFENAS foi fundada em dezembro 1988.


Em 1992 foi inaugurada a primeira ala do Hospital Universitário Alzira Velano - Hospital Escola da Faculdade de Ciências Médicas da UNIFENAS.


O curso de Medicina da UNIFENAS foi reconhecido em 29 de junho de 1994, através de portaria do MEC, publicada no Diário Oficial da União, em 30 de junho de 1994- página 9725.


Em 1998, foi autorizado pelo MEC os cursos de Residência Médica do Hospital Universitário.


Em 1999, a Faculdade de Ciências Médicas foi considerada, em pesquisa realizada pelo MEC, como a melhor faculdade de medicina entre as faculdades particulares do Estado.


A Faculdade de Medicina da UNIFENAS já formou 638 novos médicos.


Hoje, são 736 alunos matriculados no curso de Medicina no câmpus de Alfenas.